ABSTRACT We conducted the genome sequencing and analysis of the first confirmed COVID-19 infections in Brazil. Rapid sequencing coupled with phylogenetic analyses in the context of travel history corroborate multiple independent importations from Italy and local spread during the initial stage of COVID-19 transmission in Brazil.

ABSTRACT Annual vaccination is the most effective way to prevent seasonal influenza illness. Instituto Butantan (IB) performed clinical studies with its 2013, 2014 and 2015 seasonal trivalent influenza vaccines (inactivated split-virion). Prospective cohort studies were carried out to describe the safety and immunogenicity of Instituto Butantan influenza vaccines, in healthy adults and elderly, from 2013 to 2015. Immediately after the informed consent was signed, participants underwent blood collection followed by vaccination. On study days 1, 2 and 3 post-vaccination participants were contacted by the staff to evaluate the occurrence of solicited (local and systemic) and non-solicited adverse reactions. On study day 21 (+7) subjects returned to the clinical site for final safety assessments and blood collection to evaluate post-vaccination immunogenicity. The immunogenicity analyses were performed by means of hemagglutination inhibition (HI) assay. The immunogenicity endpoints were: seroprotection (SPR) and seroconversion (SCR) rates and the geometric mean HI antibody titer ratio (GMTR). The 2013 study was conducted at the Centro de Referência para Imunobiológicos Especiais (CRIE) and at the Centro de Pesquisa Clínica do Instituto da Criança, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo while the 2014 and 2015 studies were conducted at CRIE. The vaccine composition followed the WHO recommendation for the Southern hemisphere seasonal influenza vaccine. Forty-seven healthy adults and 13 elderly participated in the 2013 study, 60 healthy adults and 60 elderly in the 2014 study, and 62 healthy adults and 57 elderly in the 2015 study. In the 2013, 2014 and 2015 studies, pain was the most frequent local adverse reaction and headache the most frequent systemic adverse reaction. All observed adverse reactions were classified as mild or moderate and none as severe. SPR >70% and SPR >60% were observed in adults and elderly, respectively, for the three vaccine viruses, in the 2013, 2014 and 2015 studies. SCR >40% was observed in adults, for the three vaccine viruses, only in the 2014 study and SCR >30% was observed in the elderly, for the three vaccine viruses, only in the 2013 and 2014 studies. GMTR >2.5 among adults, for the three vaccine viruses was only observed in the 2013 study and GMTR >2.0 was observed among elderly, for the three vaccine viruses, in the 2013, 2014 and 2015 studies. The 2013, 2014 and 2015 seasonal influenza vaccines produced by Instituto Butantan were safe and immunogenic according to the immunogenicity criteria defined by the European Medicines Agency (EMA).

RESUMO Este artigo fornece uma revisão sobre imunidade, diagnóstico e aspectos clínicos da doença causada por rotavírus. Também aponta as principais mudanças no perfil epidemiológico da doença diarreica e na diversidade genética das cepas circulantes de rotavírus do grupo A, após a introdução vacinal. O rotavírus do grupo A é o principal patógeno associado à gastroenterite em animais. Seu genoma RNA segmentado pode levar ao surgimento de cepas novas ou incomuns na população humana, por meio de transmissão entre espécies e eventos de rearranjo.

ABSTRACT This article provides a review of immunity, diagnosis, and clinical aspects of rotavirus disease. It also informs about the changes in epidemiology of diarrheal disease and genetic diversity of circulating group A rotavirus strains following the introduction of vaccines. Group A rotavirus is the major pathogen causing gastroenteritis in animals. Its segmented RNA genome can lead to the emergence of new or unusual strains in human populations via interspecies transmission and/or reassortment events.

ABSTRACT Acute hemorrhagic conjunctivitis (AHC) infection is highly contagious and can lead to explosive epidemics. In early February 2011, the Center for Epidemiologic Surveillance of the State of São Paulo Health Secretariat (SES-SP) in Brazil received reports of conjunctivitis outbreaks from rural areas of the state that subsequently spread statewide. This report describes that AHC epidemic and its etiologic agent. Data from the Ministry of Health Information System for Notifiable Diseases (SinanNet) and the SES-SP epidemiologic surveillance system for conjunctivitis, developed to detect outbreaks, confirm the etiologic agent, and carry out control measures, were analyzed. Eye (conjunctival swab) samples were taken from patients with clinical presentation of viral conjunctivitis to perform viral laboratory diagnosis. A total of 1 067 981 conjunctivitis cases were reported to the surveillance system for 2011; there was an increase in the number of cases in epidemiologic weeks 6–26 (summer season) versus previous years. Most cases occurred in the metropolitan region of Greater São Paulo. Of 93 collected samples, 57 tested positive for coxsackievirus-A24 (CV-A24), based on virus isolation in tissue-culture cell lines, reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), and enterovirus sequencing of RT-PCR. The data analysis showed that the fast-spreading etiologic agent of the AHC epidemic that occurred in the summer of 2011 was CV-A24. The AHC epidemic was due to an enterovirus that occurred sporadically, spread rapidly and with great magnitude, and had substantial socioeconomic impact due to the high level of absenteeism at work and school.

RESUMEN La conjuntivitis hemorrágica aguda es sumamente contagiosa y puede provocar epidemias fulminantes. A principios de febrero del 2011, el Centro para la Vigilancia Epidemiológica de la Secretaría Estatal de Salud de São Paulo (SES-SP), en el Brasil, recibió informes de brotes de conjuntivitis en zonas rurales del estado que posteriormente se difundieron por todo el territorio estatal. En este informe se describe esa epidemia de conjuntivitis hemorrágica aguda y su agente causal. Se analizaron datos del Sistema de Información para las Enfermedades de Notificación Obligatoria del Ministerio de Salud (SinanNet) y del sistema de vigilancia epidemiológica de la SES-SP para la conjuntivitis, que fue creado para detectar brotes, confirmar el agente causal y adoptar medidas de control. Se obtuvieron hisopados conjuntivales de pacientes con un cuadro clínico de conjuntivitis vírica para hacer el diagnóstico vírico en el laboratorio. En el 2011 se notificaron al sistema de vigilancia 1 067 981 casos de conjuntivitis; el número de casos observados de la semana epidemiológica 6 a la 26 (estación del verano) fue mayor que en años anteriores. La mayoría de los casos se produjeron en la zona metropolitana del gran São Paulo. De las 93 muestras obtenidas, 57 resultaron positivas para el virus Coxsackie tipo A24 (vC-A24), según los resultados del aislamiento vírico en líneas celulares obtenidas por histocultivo, la reacción en cadena de la polimerasa con retrotranscriptasa y la secuenciación enterovírica del producto de esta. El análisis de los datos reveló que el agente causal, de rápida propagación, de la epidemia de conjuntivitis hemorrágica aguda que tuvo lugar en el verano del 2011 fue el vC-A24. La epidemia se debió a un enterovirus que apareció de forma esporádica, tuvo una diseminación rápida y de gran magnitud y repercutió de manera importante en la esfera socioeconómica debido al gran ausentismo laboral y escolar que ocasionó.

RESUMO Em relação à saúde pública no Brasil, um novo cenário emergiu com o estabelecimento dos programas universais de vacinação contra o rotavírus (RV). Os resultados de cinco anos (2007-2012) de vigilância dos genótipos G e P de cepas de RV detectadas em indivíduos com gastroenterite aguda no Brasil são descritos no presente estudo. Um total de 6196 amostras fecais foi investigado utilizando ELISA e RT-PCR. RVs foram detectados em 19,1% (1181/6196). O pico de incidência de RV se deslocou de junho-agosto para setembro. RV foi detectado com menor frequência entre crianças ≤ 5 anos (19,5%) quando comparado às crianças mais velhas e adolescentes (6-18 anos) (40,6%). A distribuição genotípica mostrou um perfil diferente a cada ano: a cepa G2P[4] foi prevalente durante 2007-2010, G9P[8] em 2011 e G12P[8] em 2012. Infecções mistas (G1+G2P[4], G2+G3P[4]+P[8], G2+G12P[8]), combinações não usuais (G1P[4], G2P[6]) e cepas atípicas (G3P[3]) também foram identificadas em todo o período do estudo. A vacinação em massa pode alterar o padrão sazonal do RV. A tendência do RV em infectar crianças mais velhas e adolescentes após a implementação da vacina tem sido relatada em todo o mundo. A emergência de G2P[4] segue provavelmente a tendência mundial e, aparentemente, não está relacionada à vacinação. G12 também parece estar emergindo na população brasileira. As rápidas mudanças nos padrões de genótipos dos RVs observados durante o período desse estudo ilustram a existência de uma população dinâmica de cepas selvagens co-circulando no Brasil.

SUMMARY Regarding public health in Brazil, a new scenario emerged with the establishment of universal rotavirus (RV) vaccination programs. Herein, the data from the five years of surveillance (2007-2012) of G- and P-type RV strains isolated from individuals with acute gastroenteritis in Brazil are reported. A total of 6,196 fecal specimens were investigated by ELISA and RT-PCR. RVs were detected in 19.1% (1,181/6,196). The peak of RV incidence moved from June-August to September. RV was detected less frequently (19.5%) among children ≤ 5 years than in older children and adolescents (6-18 years) (40.6%). Genotype distribution showed a different profile for each year: G2P[4] strains were most prevalent during 2007-2010, G9P[8] in 2011, and G12P[8] in 2012. Mixed infections (G1+G2P[4], G2+G3P[4]+P[8], G2+G12P[8]), unusual combinations (G1P[4], G2P[6]), and rare strains (G3P[3]) were also identified throughout the study period. Widespread vaccination may alter the RV seasonal pattern. The finding of RV disease affecting older children and adolescents after vaccine implementation has been reported worldwide. G2P[4] emergence most likely follows a global trend seemingly unrelated to vaccination, and G12, apparently, is emerging in the Brazilian population. The rapidly changing RV genotype patterns detected during this study illustrate a dynamic population of co-circulating wildtype RVs in Brazil.

Objectives:The aim of this study was to monitor rotavirus (RV) infections in adults >18 years with acute gastroenteritis during 2004–2011 national Brazilian RV surveillance. In addition, to characterize the RV group A (RVA) strains in order to gain insight into the supposed vaccine selective pressure imposed to Brazilian children population.Methods:A total of 2102 convenient fecal specimens were investigated by ELISA, PAGE, and RT-PCR.Results:RV was detected in 203 (9.6%) of 2102 specimens, and showed a marked peak of detection in September. RVA infection was detected in 9.4% (197/2102) and RV group C (RVC) in 0.3% (6/2102). The most frequent genotypes detected in 2004 and 2005 were G9P[8] (38.5%; 5/13) and G1P[8] (54.5%; 6/11), respectively. The dominant genotype identified from 2006 to 2011 was G2P[4] (64.4%; 116/180). Detection rate varied during the 8-year period of the study from 0.7% to 12.9%.Conclusion:The high detection rate of G2P[4] in adults provides further evidence that its dominance reflects the seasonality of RVA strains instead of the supposed selective advantage created by vaccination program. It also can be suggested that adult infections may serve as a reservoir to maintain RVA strains in childhood gastroenteritis. Considering the detection rate, the evident reduction of RVA frequency observed in children after vaccine introduction was not present in adults.

IntroductionThis study aimed to monitor the seasonality of rotavirus infection, and gain insight into the variability of Brazilian strains.MethodsA total of 28 stool samples were analyzed from 698 revised cases of gastroenteritis during a norovirus outbreak in the summer of 2010 in Guarujá, Brazil. Diagnosis was performed using enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), and sequencing.ResultsRotavirus infection was detected in 17.9% (5/28) of samples; 4 samples were G2P[4] genotype, and one G2P[4]+P[6] genotype. G2 and P[4] sequences showed a genetic relationship to strains from India and Russia, respectively.ConclusionsThe seasonal pattern of rotavirus may be a consequence of human activity apart from climate factors.

OBJETIVO: Monitorar infecções causadas por rotavírus (RV) e norovírus (NoV) em crianças hospitalizadas < 5 anos com gastroenterite aguda provenientes do estado de São Paulo durante um período de 6 anos (2004-2009). MÉTODOS: Este estudo retrospectivo foi realizado em 61 centros médicos, utilizando amostras fecais coletadas por conveniência, analisadas por ensaio imunoenzimático, eletroforese em gel de poliacrilamida, transcrição reversa seguida de reação em cadeia pela polimerase e sequenciamento para caracterização dos genótipos. RESULTADOS: Infecções por RV e NoV foram detectadas em 29,6% (144/487) e 29,2% (26/89) das amostras, respectivamente. Os genótipos de RV detectados com maior frequência foram: G9P[8] em 2004; G1P[8] em 2005; G9P[8] em 2006; e G2P[4] durante os anos de 2007, 2008 e 2009. A taxa de detecção diminuiu de 36,3% (33/91) em 2004 para 4,2% (4/95) em 2009. NoV pertencente ao genogrupo GII foi encontrado em 61,6% (16/26) das amostras, e GI em 11,5% (3/26). Infecções mistas por NoV e RV foram observadas em 2,2% (2/89) das amostras, envolvendo as cepas GI+G9P[8] e GI+G2P[4]. CONCLUSÕES: A distribuição dos genótipos de RV variou com os anos, acompanhada pela redução no número de casos detectados. Ė necessário intensificar a vigilância pós-implantação da vacina contra RV, visando monitorar as cepas circulantes e sua eficácia contra possíveis genótipos emergentes. Os NoVs têm sido cada vez mais identificados como agentes etiológicos relevantes entre crianças hospitalizadas e exercem um papel importante na etiologia viral da gastroenterite pediátrica aguda no estado de São Paulo.

OBJECTIVE: To monitor rotavirus (RV) and norovirus (NoV) infections in hospitalized children < 5 years with acute gastroenteritis in the state of São Paulo, Brazil, during a 6-year period (2004- 2009). METHODS: This retrospective study was conducted with 61 medical centers with convenient surveillance fecal specimens, investigated by enzyme-linked immunosorbent assay, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis, reverse polymerase chain reaction and sequencing to genotype characterization. RESULTS: RV and NoV infections were detected in 29.6% (144∕487) and 29.2% (26/89) of the samples, respectively. The most frequent RV genotypes detected were G9P[8] in 2004; G1P[8] in 2005; G9P[8] in 2006; and G2P[4] during 2007, 2008, and 2009. Detection rate declined from 36.3% (33∕91) in 2004 to 4.2% (4/95) in 2009. NoV genogroup GII was found in 61.6% (16/26) of the samples, and GI in 11.5% (3/26). Mixed NoV-RV infections were observed in 2.2% (2/89) of the samples, involving GI+G9P[8] and GI+G2P[4] strains. CONCLUSIONS: Genotype distribution varied according to collection year, accompanied by a reduction in detection rate. Use of RV vaccine requires implementation of post-marketing surveillance to monitor RV strain diversity and its efficacy against possible new emerging genotypes. NoVs have been increasingly identified as relevant etiological agents among hospitalized children and play an important role in the viral etiology of pediatric acute gastroenteritis in the state of São Paulo.

Os norovírus (NoV) foram os primeiros agentes virais ligados à doença gastrointestinal, entretanto, eles foram, por muito tempo, considerados como causa secundária de gastroenterite, após os rotavírus. O desenvolvimento de técnicas moleculares voltadas ao diagnóstico dos NoV forneceu dados mais claros sobre o impacto epidemiológico desses vírus, os quais são, atualmente, reconhecidos não apenas como principal causa de surtos de gastroenterite não bacteriana, mas também como causa importante de gastroenterite esporádica em crianças e adultos. Esta revisão enfoca os conhecimentos necessários para compreender a sua morfologia, genética, transmissão, patogênese e controle. Uma vez que não há vacina disponível, a prevenção da infecção por NoV depende principalmente de medidas de higiene da comunidade e pessoais.

Although noroviruses (NoVs) were the first viral agents linked to gastrointestinal disease, for a long time they have been considered secondary cause of gastroenteritis, second to rotaviruses as etiologic agents. The development of molecular techniques in diagnosing NoV provided a clearer insight into the epidemiological impact of these viruses, which are currently recognized not only as the leading cause of non-bacterial gastroenteritis outbreaks, but also as a major cause of sporadic gastroenteritis in both children and adults. This review focuses on the required knowledge to understand their morphology, genetics, transmission, pathogenesis, and control. Since no vaccine is available, prevention of NoV infection relies mainly on strict community and personal hygiene measures.

RESUMO Objetivo: Descrever um surto de norovírus ocorrido em uma instituição de longa permanência no Brasil, de 8 a 29 de julho 2005. Métodos: Nas primeiras 48 a 72 horas após o início dos sintomas entre moradores da instituição de longa permanência e funcionários, as principais estratégias de controle da infecção foram: educação da equipe, reforço na higienização das mãos, implementação de precauções de contato até 48 a 72 horas após o término de sintomas, limpeza “terminal” dos quartos dos moradores e afastamento dos funcionários sintomáticos até 48 a 72 horas após o término dos sintomas. As características clínicas e epidemiológicas das infecções por norovírus foram descritas baseadas nos dados dos prontuários. Resultados: A incidência foi 41,3% entre moradores e 16,25% entre funcionários. O principal sintoma foi diarreia, acometendo 100% dos casos; 44% das amostras de fezes foram positivas pela análise RIDASCREEN® Norovirus, com a identificação do norovírus genogrupo II. Setenta por cento dos moradores eram do sexo feminino, com idade de 51 a 98 anos. Os moradores tinham, em média, duas comorbidades, sendo 87,3% com doenças cardiovasculares ou pulmonares e 47,6% com demência. Não houve recidiva do surto ou óbitos. Conclusões: As medidas precoces de prevenção associada à vigilância são estratégias que mantém as instituições de longa permanência livres de infecções por norovírus e protegem aqueles indivíduos mais vulneráveis.

ABSTRACT Objective: To describe a norovirus outbreak in a Brazilian long-term care facility from July 8 to 29, 2005. Methods: In the first 48 to 72 hours after onset of symptoms in inpatients and employees, the main infection control strategies were staff education, emphasis on hand washing, implementing contact precautions up to 48-72 hours after resolution of symptoms, complete cleaning of the rooms and exclusion of symptomatic employees from work until 48-72 hours after resolution of their symptoms. Epidemiological and clinical characteristics of the norovirus infections were described based on chart review. Results: The incidence among inpatients and employees was 41.3% and 16.25%, respectively. The main symptom was diarrhea, affecting 100% of inpatients and employees. Forty-four percent of specimens were positive by RIDASCREEN® Norovirus analyses, and identified as norovirus genogroup GII. Seventy percent of inpatients were women and their age range was 51-98 years. Inpatients had in average two comorbid conditions – 87.3% with cardiovascular or chronic pulmonary condition and 47.6% with dementia. There was not relapse or death. Conclusions: The early infection-control measures associated to surveillance are required to keep long-term care facilities free of noroviruses and to protect those who are most vulnerable.

Anticorpos para Enterovírus 71 (EV71) foram avaliados no Estado de São Paulo durante 1999-2005. O título de anticorpos neutralizantes contra EV71 foi determinado pelo ensaio microneutralização, e um título de > 1:8 foi definido como indicador de imunidade protetora. Anticorpos neutralizantes para EV71 foram observados em 12,4% (55/442) das amostras de soro, uma baixa taxa de proteção, sugerindo que a infecção pelo EV71 é incomum nesta região e que existe alta susceptibilidade a doenças relacionadas ao EV71, o que é preocupante considerando os recentes surtos asiáticos. Ainda, foi observada diferença significativa na soropositividade em relação à localização, onde 8,7% (21/241) e 16,9% (34/201) das amostras provenientes da região metropolitana de São Paulo, e demais municípios, respectivamente, apresentaram anticorpos neutralizantes para EV71. Um grande número de brasileiros vive em áreas rurais e à beira-mar, sem acesso adequado à água encanada ou saneamento. Essa situação pode contribuir para a disseminação de EV71 nessas regiões. A análise de amostras ambientais poderia gerar contribuição valiosa para estudos sobre a epidemiologia da EV71.

Antibodies to Enterovirus 71 (EV71) were evaluated in São Paulo State during 1999-2005. The titer of neutralizing antibodies against EV71 was determined by microneutralization assay, and a titer of > 1:8 was defined as indicative of protected immunity. Neutralizing antibodies to EV71 were observed in 12.4% (55/442) of sera samples, a low protective rate, suggesting that EV71 infection is uncommon in this region, but that there is a relatively high susceptibility to EV71 related diseases, which is worrying considering the recent Asian outbreaks. Also, a significant location-specific difference in seropositivity was observed. Neutralizing antibodies to EV71 were observed in 8.7% (21/241) of São Paulo metropolitan area sera samples, and 16.9% (34/201) of the sera samples from other municipalities. A high number of Brazilian residents live in country and coastal areas without adequate access to piped water or sanitation. This situation may contribute to the EV71 dissemination in these zones. The analysis of environmental samples could possibly make a valuable contribution to studies on the epidemiology of EV71.

OBJETIVOS: Em 2006, a vacina contra rotavírus foi incluída no Programa Nacional de Imunização. Este estudo teve como objetivo analisar os resultados da vigilância de genótipos de rotavírus em crianças < 5 anos com gastrenterites agudas provenientes de creches no estado de São Paulo por um período de 5 anos. MÉTODOS: Este estudo retrospectivo foi realizado em 30 creches no período de 2004 a 2008, com amostras fecais convenientes da vigilância das diarreias agudas, analisadas por ELISA, SDS-PAGE, RT-PCR e sequenciamento genético para caracterização do genótipo. RESULTADOS: Infecções por rotavírus foram detectadas em 28,3% de amostras (38/134). Os genótipos mais frequentes detectados foram: G9P[8] e G1P[8] em 2004; G1P[8] em 2005; GNTP[NT] em 2006; G2P[4] em 2007; e nenhum caso foi relatado em 2008. Infecções mistas não foram observadas. A taxa de detecção diminuiu de 65,7% (23/35) em 2004 para 50% (9/18) em 2007. CONCLUSÕES: A distribuição do genótipo variou de acordo com os anos, acompanhada pela redução no número de casos detectados. É necessário intensificar a vigilância pós-implantação da vacina contra rotavírus, visando monitorar as linhagens circulantes e sua eficácia contra possíveis genótipos emergentes.

OBJECTIVES: In 2006 the rotavirus vaccine was included in the Brazilian Immunization Program. The aim of this study was to report the results of a 5-year surveillance study of rotavirus strains in children < 5 years with acute gastroenteritis from day care centers in the state of São Paulo, Brazil. METHODS: This retrospective study was conducted with 30 day care centers from 2004 to 2008 with convenient surveillance fecal specimens, investigated by ELISA, SDS-PAGE, RT-PCR and gene sequencing to genotype characterization. RESULTS: Rotavirus infection was detected in 28.3% of samples (38/134). The most frequent genotypes detected were G9P[8] and G1P[8] in 2004; G1P[8] in 2005; GNTP[NT] in 2006; G2P[4] in 2007; and there were no cases in 2008. Mixed infections were not observed. Detection rate declined from 65.7% (23/35) in 2004 to 50% (9/18) in 2007. CONCLUSIONS: Genotype distribution varied according to collection year, accompanied by a reduction in detection rate. Use of rotavirus vaccine requires implementation of post-marketing surveillance to monitor rotavirus strain diversity and its efficacy against possible new emerging genotypes.

Norovírus (NoV), anteriormente chamado Norwalk-like vírus, constituem um importante grupo de patógeno humano associado a surtos de gastroenterites não bacterianas. Levantamentos epidemiológicos de surtos demonstram que as mais importantes vias de transmissão são contatos pessoa-pessoa, água e alimentos contaminados, afetando adultos e crianças. Os NoV são classificados em genogrupos, sendo os genogrupos GI, GII e GIV encontrados em humanos. A grande diversidade genética dos NoV e a falta de informação sobre esses vírus no Brasil determinaram o tema deste estudo que teve como objetivo a identificação e caracterização molecular de NoV em amostras fecais de pacientes com gastroenterites, provenientes de surtos de diarréia no estado de São Paulo. Neste estudo, 204 amostras de fezes coletadas durante surto de diarréia foram analisadas por RT-PCR, e 12 foram seqüenciadas para confirmar o genogrupo. O método one step PCR foi empregado para a amplificação da região B da ORF1 com o pool de primers MON 431, 432, 433 e 434. Do total, 32 (15,7%) amostras foram positivas para norovírus genogrupo GII. A comparação das seqüências dos produtos de PCR às seqüências do GenBank demonstrou 88,8% a 98,8% de identidade, sugerindo a presença de norovírus genogrupo GII em surtos de gastroenterites no Estado de São Paulo.

Norovirus (NoV), previously called Norwalk-like virus, represents an important group of human pathogens associated with outbreaks of nonbacterial gastroenteritis. Epidemiological surveys of outbreaks have shown that the most important routes of transmission are person-to-person contacts and contaminated food and water, with the virus affecting adults and children. NoV is classified into genogroups, being genogroups GI, GII and GIV found in humans. In view of the high genetic diversity of NoV and the lack of information about this virus in Brazil, the aim of the present study was the molecular characterization of NoV isolated from diarrheic stool samples of patients from São Paulo State. In this study, 204 stool specimens collected during diarrhea outbreaks were analyzed by RT-PCR, and 12 were sequenced for genogroup confirmation. One-step PCR was performed in order to amplify the B region of ORF 1 using the MON 431, 432, 433 and 434 primer pool. From total, 32 (15.7%) stool specimens were positive for NoV genogroup GII. Comparison of the sequences of the PCR products to GenBank sequences showed 88.8% to 98.8% identity, suggesting the presence of genogroup GII in gastroenteritis outbreaks in São Paulo State.

Exantema viral é considerado problema comum em regiões tropicais, afetando principalmente crianças. Diversos exantemas cutâneos estão associados a infecções por Enterovirus. Amostras biológicas provenientes de uma criança apresentando exantema generalizado foram enviadas ao Laboratório de Vírus Entéricos do Instituto Adolfo Lutz para a realização do diagnóstico laboratorial. Amostra viral isolada em RD (human rhabdomyosarcoma cells) foi submetida à reação em cadeia pela polimerase apresentando um produto de 437 pares de base, característico de gênero Enterovirus. O sorotipo echovirus 6 (E-6) foi identificado por ensaio de imunofluorescência indireta. Em adição, as amostras pareadas de soro apresentaram soroconversão para E-6. Até o momento, não há relatos do envolvimento de E-6 associado a doenças exantemáticas no Brasil, enfatizando a importância da vigilância epidemiológica para essas doenças e suas complicações.

Viral exanthems are a common problem in tropical regions, particularly affecting children. Various skin rashes have been reported in acute infections caused by Enterovirus. Biological samples from a child who presented generalized rashes were sent to the Enteric Virus Laboratory of the Adolfo Lutz Institute for laboratory diagnosis to be performed. A viral sample isolated from RD (human rhabdomyosarcoma cells) was subjected to the polymerase chain reaction and showed a 437-base pair product that was characteristic of the Enterovirus genus. Echovirus 6 (E-6) serotype was identified using the indirect immunofluorescence test. In addition, paired serum samples presented seroconversion to E-6. So far, there have not been any reports of E-6 involvement in exanthematic diseases in Brazil. Thus, the importance of epidemiological surveillance for these diseases and their complications is emphasized.